本报讯 美国威尔康奈尔医学院的Ivan Raimondi团队研究了调控DNA-蛋白相互作用的单细胞定位。相关研究成果近日发表于《细胞》。
研究人员开发了对接和脱胺，然后进行测序（D&D-seq），用于分析DNA-蛋白质相互作用。D&D-seq将抗体结合纳米体与胞嘧啶碱基编辑器结合，这种组合可以通过靶向胞嘧啶-尿嘧啶编辑在蛋白质结合的基因组位点检测弱或短暂的因子结合。这种方法与标准的单细胞多组工作流程兼容，因此可以对基因调控进行综合分析。利用转座酶可及染色质主题测序（ATAC-seq）和单细胞ATAC-seq （scATAC-seq）测定，研究小组评估了染色质可及性作为TF活性的功能读数，并通过D&D-seq与全基因组测序相结合，捕获了CTCF在活性和非活性染色质区室中的结合。
不过，在单细胞中绘制这些相互作用，特别是那些弱亲和力或短暂性的相互作用，在技术上仍然具有挑战性。（柯讯）
相关论文信息：https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.05.014
《医学科学报》 (2026-08-07 第10版 国际)
