作者:柯讯 来源: 医学科学报 发布时间:2023-3-3
选择字号:
新算法预测人体肠道微生物群代谢途径

 

本报讯 美国斯坦福大学Dylan Dodd、Michael A. Fischbach和荷兰瓦赫宁根大学Marnix H. Medema共同合作,研究开发了gutSMASH算法,可以预测人体肠道微生物群的特化初级代谢途径。相关成果近日在线发表于《自然-生物技术》。

尽管研究人员已努力确定次级代谢产物的生物合成基因,但肠道微生物组的化学输出主要由初级代谢产物组成。

研究人员介绍了用于识别初级代谢基因簇的gutSMASH算法,并使用它系统地描述了肠道微生物组代谢,在4240个高质量微生物基因组中识别了19890个基因簇。研究人员发现之间的路径分布存在显著差异,反映了不同的能量捕获策略。这些数据解释了短链脂肪酸生产的分类差异,并提出了每个分类单元的特征代谢生态位。对荷兰人群队列中1135名个体的分析表明,血浆和粪便中微生物组来源的代谢产物水平几乎与相应代谢基因的宏基因组丰度完全无关,这表明了通路特异性基因调节和代谢产物通量的关键作用。(柯讯)

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41587-023-01675-1

《医学科学报》 (2023-03-03 第9版 国际)
 
 打印  发E-mail给: 
    
 
相关新闻 相关论文

图片新闻
中国超重元素研究加速器装置刷新纪录 彩色油菜花又添7色!总花色达70种
考研复试,导师心仪这样的学生! 地球刚刚经历最热2月
>>更多
 
一周新闻排行
 
编辑部推荐博文