本报讯 德国马普生物化学研究所Matthias Mann团队绘制了酵母蛋白相互作用组的社会架构图谱。相关研究近日在线发表于《自然》。

据介绍，细胞功能是由蛋白质-蛋白质相互作用介导的，绘制相互作用组提供了对生物系统的基本见解。亲和纯化与质谱联用是进行此类图谱绘制的理想工具，但很难识别低拷贝数复合物、膜复合物和被蛋白质标记破坏的复合物。目前人们对相互作用组的了解还不够完整，评估报告的相互作用的可靠性是具有挑战性的。

研究人员开发了一种灵敏的高通量方法，使用高度可重复的亲和富集与质谱联用，结合定量二维分析策略，全面绘制酿酒酵母的相互作用组。与现有的相互作用图谱相比，蛋白质数量增加了1倍，可靠相互作用的数量增加了3倍。这包括通过丰度相关性推断的极低丰度的表观遗传复合物、器官膜复合物和不可标记的复合物。

这个几乎饱和的相互作用组揭示了绝大多数酵母蛋白是高度连接的，平均有16个相互作用因子。与人类之间的社交网络类似，蛋白质之间的平均最短距离为4.2次相互作用。（柯讯）

相关论文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-023-06739-5