本报讯 美国斯坦福大学Michael Snyder等研究人员揭示了人类癌症基因组中反复出现的重复扩展(rRE)。相关论文近日发表于《自然》。
研究人员在29种癌症类型的2622个癌症基因组中确定了串联重复(TR)的扩展。在7种癌症类型中,研究人员发现了160个rRE,其中大部分(155/160)是亚型特异的。研究人员发现rRE在基因组中的分布是不均匀的,在候选顺式调控元件附近富集,这表明其在基因调控中的潜在作用。研究人员在34%的肾细胞癌样本中检测到一个rRE,即GAA-重复扩增,位于UGT2B7第一个内含子的调控元件附近,并通过长读DNA测序进行了验证。
此外,在初步实验中,研究人员用一种GAA靶向分子处理藏有这种rRE的细胞,导致细胞增殖的剂量依赖性下降。研究表明,rRE可能是人类癌症遗传变异的一个重要但未开发的来源。研究人员提供了一个全面的图谱供进一步研究。
据介绍,单一重复性DNA序列的扩展可引起50多种疾病。然而,除了神经系统和神经退行性疾病之外,人们往往没有对rRE进行探讨。在一些癌症中,突变会在TR的短链中积累,然而,较大的rRE在癌症中还没有被系统分析过。(柯讯)
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41586-022-05515-1
《医学科学报》 (2023-01-06 第10版 国际)