本报讯 英国韦尔科姆基金会桑格研究所Thomas J. Mitchell等研究人员绘制了肾癌瘤内和相关区域的单细胞转录组图谱。相关论文近日发表于《癌细胞》。

研究人员表示，肿瘤行为依赖于癌细胞的致癌特性及其多细胞的相互作用。为广泛了解微环境中的肿瘤行为依赖，研究人员报告了12名肾脏肿瘤患者的27万多个单细胞转录组和100个显微切割组织的全外显子，并用空间转录组学进行验证。这些组织取自肿瘤核心、肿瘤-正常界面、周围正常组织和外周血等多个区域。研究人员发现，CD8+T细胞克隆型的组织类型位置在很大程度上定义了它们的耗竭状态，而肿瘤内的空间异质性并不能很好解释体细胞异质性。根据单细胞RNA测序数据的新突变调用，研究人员能广泛推断基质细胞的克隆性并利用谱系追踪髓系细胞的发展。

研究人员报告了区分肿瘤细胞功能的6个保守元程序，发现上皮-间质转化元程序在肿瘤-正常界面高度富集，与表达IL1B的巨噬细胞共同定位，提供了潜在的治疗靶点。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.ccell.2022.11.001